More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81799 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  100 
 
 
592 aa  1205    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  52.77 
 
 
592 aa  552  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76845 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  51.92 
 
 
695 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_2648  predicted protein  60.13 
 
 
326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31385  predicted protein  50.16 
 
 
462 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000357166  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12783  predicted protein  49.85 
 
 
363 aa  344  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_13512  predicted protein  65.24 
 
 
230 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186669  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13210  predicted protein  65.24 
 
 
230 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00422519 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04330  cell division control protein, putative  47.19 
 
 
525 aa  299  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  41.76 
 
 
606 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57298  predicted protein  30.36 
 
 
457 aa  159  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  33.79 
 
 
1443 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.11 
 
 
1652 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.26 
 
 
696 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.43 
 
 
1831 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45416  predicted protein  30.07 
 
 
632 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.03 
 
 
664 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.89 
 
 
596 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 
947 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.27 
 
 
919 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.76 
 
 
1523 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.2 
 
 
1364 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.17 
 
 
1163 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.45 
 
 
682 aa  97.8  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.2 
 
 
1760 aa  97.8  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.98 
 
 
698 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.93 
 
 
1221 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  30.48 
 
 
657 aa  94  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.15 
 
 
677 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.99 
 
 
578 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.83 
 
 
778 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  29.88 
 
 
516 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.64 
 
 
1363 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  27.99 
 
 
551 aa  90.9  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  27.3 
 
 
774 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.37 
 
 
1474 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 
1247 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.51 
 
 
1868 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.05 
 
 
443 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.96 
 
 
1190 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24 
 
 
1193 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19210  predicted protein  47.52 
 
 
300 aa  87.8  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.103438  hitchhiker  0.00628492 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17898  predicted protein  47.52 
 
 
300 aa  87.8  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.33 
 
 
1357 aa  87.4  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.92 
 
 
576 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.9 
 
 
1188 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.04 
 
 
434 aa  87  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.38 
 
 
1454 aa  87  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  27.76 
 
 
402 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.07 
 
 
930 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.64 
 
 
733 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.67 
 
 
1557 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.23 
 
 
1196 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  25.32 
 
 
495 aa  85.5  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.39 
 
 
742 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  24.92 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.86 
 
 
1236 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.41 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.74 
 
 
1553 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  27.42 
 
 
316 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 
316 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.19 
 
 
676 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  23.94 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.24 
 
 
630 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  32.28 
 
 
589 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.55 
 
 
642 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.42 
 
 
1211 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.64 
 
 
1901 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  24.36 
 
 
511 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  24.6 
 
 
316 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.9 
 
 
1262 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.19 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.17 
 
 
1711 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26.03 
 
 
1484 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  24.29 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 
464 aa  77.8  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.71 
 
 
565 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  25.75 
 
 
1041 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.34 
 
 
1240 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 
1789 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 
1208 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 
1686 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.03 
 
 
618 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.05 
 
 
675 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
1039 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.68 
 
 
608 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.12 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.44 
 
 
608 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  24.81 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.32 
 
 
1416 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.09 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.9 
 
 
740 aa  74.3  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  25.68 
 
 
597 aa  73.9  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.14 
 
 
716 aa  73.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.67 
 
 
1510 aa  73.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  24.08 
 
 
363 aa  73.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 
1399 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 
1161 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.18 
 
 
1411 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>