119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57298 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57298  predicted protein  100 
 
 
457 aa  948    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04330  cell division control protein, putative  33.33 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  30.77 
 
 
592 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76845 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  30.36 
 
 
592 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 
695 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  30.17 
 
 
606 aa  156  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31385  predicted protein  30.09 
 
 
462 aa  153  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000357166  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12783  predicted protein  29.1 
 
 
363 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00814  cell division cycle protein Cdc20, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14730)  31.82 
 
 
618 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_2648  predicted protein  30.19 
 
 
326 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13210  predicted protein  33.48 
 
 
230 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00422519 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_13512  predicted protein  33.48 
 
 
230 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186669  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01982  cell cycle regulatory protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10570)  30.33 
 
 
818 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.7 
 
 
1760 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.44 
 
 
576 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  23.14 
 
 
578 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.55 
 
 
696 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24 
 
 
565 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.71 
 
 
930 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.18 
 
 
1652 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  24.66 
 
 
1100 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.51 
 
 
1221 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.07 
 
 
1553 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 
778 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.11 
 
 
1481 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  22.26 
 
 
608 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.85 
 
 
1364 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.85 
 
 
1510 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.88 
 
 
1858 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.42 
 
 
1247 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.49 
 
 
1229 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.81 
 
 
676 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.19 
 
 
919 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.97 
 
 
1161 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.61 
 
 
677 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  18.97 
 
 
344 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 
344 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  22.55 
 
 
742 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 
1686 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
1190 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.64 
 
 
924 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34219  predicted protein  21.73 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.6 
 
 
1072 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.37 
 
 
1411 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.39 
 
 
1240 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.22 
 
 
630 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.26 
 
 
1304 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.93 
 
 
806 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.73 
 
 
1188 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.4 
 
 
1177 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  20.52 
 
 
1196 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  27.34 
 
 
423 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.63 
 
 
596 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.4 
 
 
947 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.03 
 
 
1072 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.69 
 
 
1711 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  22.92 
 
 
522 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.74 
 
 
1477 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.3 
 
 
1523 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.29 
 
 
1161 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.78 
 
 
1211 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  20.65 
 
 
505 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 
1474 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.77 
 
 
1039 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  23.77 
 
 
954 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.26 
 
 
664 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 
1041 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.29 
 
 
589 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.15 
 
 
1661 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.63 
 
 
642 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.31 
 
 
792 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  20.55 
 
 
657 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 
1656 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  22.49 
 
 
652 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.94 
 
 
1823 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  29.88 
 
 
1657 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.03 
 
 
1557 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.34 
 
 
1076 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17898  predicted protein  58.33 
 
 
300 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208361 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19210  predicted protein  58.33 
 
 
300 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.103438  hitchhiker  0.00628492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1214 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.86 
 
 
1236 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  22.07 
 
 
1357 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  21.37 
 
 
1807 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.05 
 
 
757 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  20.62 
 
 
1789 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.15 
 
 
1213 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.35 
 
 
434 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  23.12 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.95 
 
 
865 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  24.84 
 
 
551 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  24.35 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  20 
 
 
1163 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.29 
 
 
675 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  22.98 
 
 
1334 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  24.35 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.58 
 
 
1399 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  20.28 
 
 
1901 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.92 
 
 
1193 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 
1279 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>