291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31740 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  100 
 
 
458 aa  954    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05235  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09620)  30.25 
 
 
469 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.783705  normal  0.0488929 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  30.25 
 
 
459 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3307  predicted protein  26.47 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272794  normal  0.166953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.09 
 
 
1443 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.98 
 
 
1831 aa  73.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.82 
 
 
1652 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 
696 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 
1193 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  26.15 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.27 
 
 
1221 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.47 
 
 
1163 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.51 
 
 
1188 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  22.01 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  29.03 
 
 
522 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24 
 
 
1557 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 
1363 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  31.25 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.45 
 
 
1262 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.44 
 
 
1856 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29147  predicted protein  25.1 
 
 
438 aa  63.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.72 
 
 
930 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  27.39 
 
 
520 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.37 
 
 
792 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
511 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.43 
 
 
1247 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.61 
 
 
1868 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  27.49 
 
 
518 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  23.32 
 
 
520 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.09 
 
 
596 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  23.32 
 
 
520 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.48 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  25.67 
 
 
617 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.34 
 
 
1236 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.77 
 
 
434 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.99 
 
 
618 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.29 
 
 
742 aa  60.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43574  predicted protein  26.58 
 
 
499 aa  60.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  25.47 
 
 
333 aa  60.1  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.62 
 
 
682 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1760 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.47 
 
 
642 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  24.54 
 
 
484 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.27 
 
 
1411 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  22.18 
 
 
402 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  24.81 
 
 
567 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48514  predicted protein  25.48 
 
 
931 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06867  Mitochondrial division protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXW3]  26.48 
 
 
654 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  0.183492 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.44 
 
 
1364 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 
577 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  29.03 
 
 
962 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.73 
 
 
947 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.54 
 
 
1196 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  23.51 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.58 
 
 
1213 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 
1686 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42488  predicted protein  31.54 
 
 
467 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.206932 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  26.71 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  25.09 
 
 
307 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.78 
 
 
943 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  25.48 
 
 
435 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.84 
 
 
1217 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.32 
 
 
676 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.46 
 
 
790 aa  56.6  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.22 
 
 
1523 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.46 
 
 
1807 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  22.22 
 
 
678 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.2 
 
 
919 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
1427 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43401  predicted protein  29.5 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0388666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.91 
 
 
443 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.01 
 
 
1041 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.34 
 
 
1039 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
712 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77577  predicted protein  23.17 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140493  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  25.67 
 
 
928 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.71 
 
 
576 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.56 
 
 
1599 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  27.59 
 
 
423 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.05 
 
 
618 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.46 
 
 
1901 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.08 
 
 
1607 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  21.74 
 
 
782 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.12 
 
 
1208 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  23.75 
 
 
541 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.79 
 
 
630 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  25 
 
 
1205 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  24.51 
 
 
317 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05570  ER to Golgi transport-related protein, putative  32.8 
 
 
829 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446639  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  26.41 
 
 
466 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  25.63 
 
 
500 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.26 
 
 
924 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.66 
 
 
733 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  22.06 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.89 
 
 
1474 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.74 
 
 
636 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  23.95 
 
 
452 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.63 
 
 
865 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.94 
 
 
1357 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11703  predicted protein  23.51 
 
 
820 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>