208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43574 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43574  predicted protein  100 
 
 
499 aa  1024    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29147  predicted protein  27.13 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42488  predicted protein  28.14 
 
 
467 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.206932 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00480  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  24.1 
 
 
486 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.18 
 
 
1443 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04469  Ribosome biogenesis protein ytm1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R1]  23.5 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342767  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.45 
 
 
1363 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  26.39 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 
1163 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.57 
 
 
1868 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.1 
 
 
1831 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.03 
 
 
676 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 
947 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.33 
 
 
1411 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  31.03 
 
 
333 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.3 
 
 
1193 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  26.44 
 
 
344 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.82 
 
 
1474 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  26.25 
 
 
485 aa  65.1  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.16 
 
 
1236 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1196 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 
1247 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.97 
 
 
1190 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.73 
 
 
740 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  25.95 
 
 
484 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.95 
 
 
924 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.67 
 
 
1557 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  26.58 
 
 
458 aa  60.1  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
682 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.29 
 
 
682 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.81 
 
 
930 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  32.43 
 
 
317 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.35 
 
 
576 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  25.21 
 
 
678 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.95 
 
 
1652 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.1 
 
 
1188 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  35.43 
 
 
520 aa  58.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 
1240 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.63 
 
 
1213 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.15 
 
 
1221 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.25 
 
 
1553 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.47 
 
 
505 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.41 
 
 
1214 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.79 
 
 
742 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 
1686 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.72 
 
 
1510 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.49 
 
 
1856 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.22 
 
 
1208 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.21 
 
 
1858 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  31.97 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3307  predicted protein  32.46 
 
 
373 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272794  normal  0.166953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.08 
 
 
1161 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 
1481 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.56 
 
 
664 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  31.67 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  25.71 
 
 
522 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
577 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 
1760 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  25 
 
 
782 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.95 
 
 
1161 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43401  predicted protein  31.01 
 
 
564 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0388666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  28.97 
 
 
405 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  28.65 
 
 
441 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 
344 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.71 
 
 
630 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.84 
 
 
1364 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  32.48 
 
 
518 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.49 
 
 
1097 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 
652 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.09 
 
 
696 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  24.5 
 
 
521 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  32.43 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.63 
 
 
1523 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.83 
 
 
1454 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.92 
 
 
943 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  23.49 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.22 
 
 
1072 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  28.03 
 
 
618 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06341  putative coronin homolog (Eurofung)  26.14 
 
 
611 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.592518  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 
1878 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.83 
 
 
1607 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  23.22 
 
 
473 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  23.16 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  28.03 
 
 
612 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.138944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.44 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06867  Mitochondrial division protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXW3]  24.47 
 
 
654 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  0.183492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.16 
 
 
344 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.4 
 
 
1176 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42847  predicted protein  23.18 
 
 
984 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.451507  normal  0.305439 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
687 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 
1334 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.6 
 
 
1072 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01830  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  21.31 
 
 
323 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.3 
 
 
692 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 
1344 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 
1188 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.23 
 
 
1656 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.72 
 
 
1217 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.03 
 
 
675 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>