110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00480 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN00480  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  100 
 
 		 486 aa  985    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04469  Ribosome biogenesis protein ytm1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R1]  29.02 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342767  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42488  predicted protein  26.96 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.206932 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29147  predicted protein  26.25 
 
 		 438 aa  127  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43574  predicted protein  24.1 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 1831 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  22.18 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.58 
 
 		 930 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 1760 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.58 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1097 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.27 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.09 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.15 
 
 		 898 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  24.18 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.93 
 
 		 740 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25 
 
 		 1523 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5500  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.65 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.14 
 
 		 742 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  23.59 
 
 		 1484 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.43 
 
 		 1868 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.2 
 
 		 692 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25 
 
 		 1280 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.46 
 
 		 733 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.08 
 
 		 1856 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.95 
 
 		 1599 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1196 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  27.13 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.28 
 
 		 1236 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  27.17 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  28.26 
 
 		 426 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.51 
 
 		 676 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.35 
 
 		 1481 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.31 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.83 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.99 
 
 		 947 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.82 
 
 		 1454 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.29 
 
 		 1039 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3194  cytochrome c class I  31.72 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  23.43 
 
 		 264 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  26.1 
 
 		 1100 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1214 aa  50.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  23.75 
 
 		 618 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.57 
 
 		 1262 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1474 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  24.93 
 
 		 870 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  22.38 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.29 
 
 		 682 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.69 
 
 		 1652 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  26.87 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.34 
 
 		 1188 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.52 
 
 		 1363 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.36 
 
 		 1213 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.07 
 
 		 522 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.19 
 
 		 1242 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.12 
 
 		 578 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1807 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  26.99 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  30.83 
 
 		 411 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  26.13 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  25.94 
 
 		 324 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.92 
 
 		 682 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.49 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  26.43 
 
 		 521 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  26.29 
 
 		 458 aa  47.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1117 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 1163 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  28.46 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 1221 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  27.57 
 
 		 484 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.91 
 
 		 1443 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  26.9 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.16 
 
 		 1076 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1858 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  20.95 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  25.79 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  28.77 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.7 
 
 		 1208 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  31.34 
 
 		 652 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 1878 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  21.89 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.42 
 
 		 1557 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.74 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  29.46 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1041 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1355 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.89 
 
 		 1901 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  22.58 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.19 
 
 		 696 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.02 
 
 		 1364 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.78 
 
 		 1686 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.2 
 
 		 1072 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 		 1190 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.93 
 
 		 1267 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 		 687 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1553 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  24.44 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>