184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8842 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  100 
 
 
379 aa  789    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  37.3 
 
 
535 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  34.99 
 
 
538 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68798  periodic tryptophan protein 1  32.76 
 
 
566 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.715644 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01250  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 
582 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.24 
 
 
696 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  26.89 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.43 
 
 
1217 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29 
 
 
1760 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.56 
 
 
1652 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.69 
 
 
947 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  23.31 
 
 
432 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
1557 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.2 
 
 
1858 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  22.64 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  23.87 
 
 
466 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  33.14 
 
 
1831 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  24 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  29.79 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.91 
 
 
1221 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.14 
 
 
1357 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.81 
 
 
919 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 
1344 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.61 
 
 
898 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.38 
 
 
1553 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 
1264 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 
1264 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  26.7 
 
 
652 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.94 
 
 
1188 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.64 
 
 
1163 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00065  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12370)  26.16 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371171 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  25 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.22 
 
 
1209 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.53 
 
 
1510 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  28.11 
 
 
495 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  22.83 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.44 
 
 
757 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.35 
 
 
676 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  30.53 
 
 
1355 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.28 
 
 
576 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 
1481 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82025  predicted protein  25.36 
 
 
460 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.830676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 
1363 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.05 
 
 
1240 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.88 
 
 
742 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.02 
 
 
737 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.73 
 
 
1443 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  26.14 
 
 
551 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.27 
 
 
1004 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 
461 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  28.89 
 
 
1657 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  28.64 
 
 
790 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  29.87 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.52 
 
 
865 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  22.45 
 
 
492 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  24.18 
 
 
518 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.04 
 
 
618 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.71 
 
 
833 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.13 
 
 
1193 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  33.33 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.57 
 
 
1229 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.5 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.07 
 
 
1789 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  25.97 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  23.37 
 
 
489 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06060  histone deacetylation-related protein, putative  32.09 
 
 
763 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.84 
 
 
1686 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.19 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.9 
 
 
930 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.22 
 
 
1714 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  29.73 
 
 
486 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.85 
 
 
1364 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39452  predicted protein  24.86 
 
 
1077 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.11 
 
 
1164 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.9 
 
 
682 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.19 
 
 
1661 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.81 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.1 
 
 
682 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.15 
 
 
664 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.34 
 
 
1262 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  23.39 
 
 
344 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.45 
 
 
434 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03737  WD repeat-containing protein AN3737 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6U3]  31.21 
 
 
525 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  24.88 
 
 
622 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.17 
 
 
1552 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.76 
 
 
1607 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.22 
 
 
1236 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.33 
 
 
924 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06341  putative coronin homolog (Eurofung)  29.25 
 
 
611 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.592518  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  32.54 
 
 
1462 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  24.88 
 
 
1117 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  27.41 
 
 
458 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  23.95 
 
 
617 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.94 
 
 
1901 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.51 
 
 
1474 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.59 
 
 
716 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 
1411 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 
540 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  26.59 
 
 
484 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>