107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01250 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ01250  conserved hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1178    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118456  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  37.09 
 
 
535 aa  330  6e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68798  periodic tryptophan protein 1  32.15 
 
 
566 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.715644 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  31.95 
 
 
538 aa  204  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  28.75 
 
 
379 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.03 
 
 
1363 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.27 
 
 
1217 aa  67.4  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.98 
 
 
1443 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  27.65 
 
 
813 aa  60.8  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29180  predicted protein  30.05 
 
 
505 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.648326  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  24.8 
 
 
344 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.81 
 
 
1652 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  26.94 
 
 
541 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  24.15 
 
 
518 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 
1163 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.54 
 
 
1236 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42488  predicted protein  30.3 
 
 
467 aa  54.3  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.206932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.56 
 
 
698 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  24 
 
 
333 aa  53.5  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  24.3 
 
 
870 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.44 
 
 
1221 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.66 
 
 
1510 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39580  predicted protein  26.37 
 
 
376 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  22.29 
 
 
520 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.09 
 
 
1523 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 
1344 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  21.68 
 
 
447 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05196  mRNA splicing factor (Prp17), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07300)  24.62 
 
 
531 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  24.23 
 
 
652 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.2 
 
 
1004 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  25.36 
 
 
374 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.37 
 
 
576 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82025  predicted protein  22.67 
 
 
460 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.830676 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61538  histone acetyltransferase subunit  22.76 
 
 
397 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.43 
 
 
1348 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 
1878 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05930  snoRNA binding protein, putative  22.88 
 
 
1382 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192675  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.26 
 
 
682 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  21.92 
 
 
782 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.1 
 
 
1831 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.09 
 
 
1557 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.44 
 
 
778 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.71 
 
 
1491 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 
696 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.74 
 
 
1208 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  21.59 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21897  G protein beta subunit  29.27 
 
 
351 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173476  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  23.35 
 
 
516 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.17 
 
 
1656 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 
1766 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.07 
 
 
1304 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38176  predicted protein  26.99 
 
 
650 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  24.77 
 
 
492 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.82 
 
 
919 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.2 
 
 
1868 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.03 
 
 
505 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.83 
 
 
692 aa  47  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  25.95 
 
 
441 aa  47  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00292  transcription initiation factor TFIID subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03070)  23.53 
 
 
606 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00299159  normal  0.644069 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  35.71 
 
 
756 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  24.19 
 
 
435 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.82 
 
 
833 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  21.82 
 
 
1858 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  22.44 
 
 
461 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.66 
 
 
1411 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  20.31 
 
 
1247 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.38 
 
 
740 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  24.69 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  24.86 
 
 
1289 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  24.08 
 
 
489 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.69 
 
 
1211 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.61 
 
 
1760 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.77 
 
 
1481 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.03 
 
 
924 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46672  WD repeat protein  28.64 
 
 
317 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  23.27 
 
 
1244 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  22.01 
 
 
319 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_50969  predicted protein  21.67 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627207  hitchhiker  0.000441065 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  22.62 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.1 
 
 
1188 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  35.29 
 
 
355 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.619902 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01379  Putative uncharacterized proteinSONA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74224]  22.7 
 
 
362 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.389246  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04771  ribosomal assembly complex component Ipi3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06580)  25.87 
 
 
573 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855526  normal  0.61445 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02070  trp-asp repeats containing protein, putative  25.49 
 
 
757 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  26.7 
 
 
551 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.49 
 
 
1714 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.49 
 
 
664 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  30.48 
 
 
617 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  22.94 
 
 
432 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04460  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07540)  27.39 
 
 
977 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.693918  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  27.78 
 
 
523 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 
1711 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  24.24 
 
 
678 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  24.93 
 
 
1311 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.04 
 
 
1856 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.51 
 
 
596 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.57 
 
 
574 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  25.13 
 
 
1275 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.83 
 
 
1789 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.6 
 
 
947 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>