165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39580 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_39580  predicted protein  100 
 
 
376 aa  788    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  44.2 
 
 
355 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  34.42 
 
 
333 aa  224  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  34.58 
 
 
344 aa  222  7e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.39 
 
 
1652 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47947  g-protein beta-subunit  21.72 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000283935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.8 
 
 
1363 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 
1686 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 
1163 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02800  H3/H4 histone acetyltransferase, putative  23.72 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  22.31 
 
 
1491 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82025  predicted protein  23 
 
 
460 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.830676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.75 
 
 
1217 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.17 
 
 
1221 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.95 
 
 
1510 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.32 
 
 
1858 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.2 
 
 
1599 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.53 
 
 
1443 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  24.54 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 
1213 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.35 
 
 
947 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 
1557 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.66 
 
 
1598 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.19 
 
 
930 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.15 
 
 
740 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  20.86 
 
 
505 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.04 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.14 
 
 
898 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 
1348 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.44 
 
 
1626 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.95 
 
 
1164 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.24 
 
 
1617 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.46 
 
 
1760 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.36 
 
 
1193 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.06 
 
 
1553 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  21.79 
 
 
1196 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  25.6 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.46 
 
 
1474 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.45 
 
 
1481 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.13 
 
 
1789 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  28 
 
 
518 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.05 
 
 
1583 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.22 
 
 
792 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.53 
 
 
1547 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  21.67 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.06 
 
 
682 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  24.54 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01250  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 
582 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.47 
 
 
1868 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 
1211 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.27 
 
 
1190 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.31 
 
 
1357 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43574  predicted protein  25.09 
 
 
499 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  22.87 
 
 
489 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 
652 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  23.21 
 
 
618 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  26.32 
 
 
1462 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.86 
 
 
1267 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.74 
 
 
574 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  18.7 
 
 
538 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.88 
 
 
1856 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 
1878 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.67 
 
 
1901 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.72 
 
 
919 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.77 
 
 
1607 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.49 
 
 
1609 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  23.58 
 
 
564 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.88 
 
 
1262 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 
1552 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  22 
 
 
344 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  25.54 
 
 
935 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.43 
 
 
716 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.9 
 
 
1398 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.84 
 
 
1661 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.26 
 
 
1240 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  21.07 
 
 
612 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.06 
 
 
1236 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
1176 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 
316 aa  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.83 
 
 
692 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  25.32 
 
 
551 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46891  predicted protein  25.32 
 
 
1007 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.12 
 
 
1161 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  25.93 
 
 
441 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.57 
 
 
1656 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.87 
 
 
1623 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  21.34 
 
 
657 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.02 
 
 
677 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.71 
 
 
1454 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  21.56 
 
 
485 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.43 
 
 
1523 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  22.22 
 
 
1100 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.49 
 
 
865 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  22.06 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.83 
 
 
676 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.71 
 
 
833 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.32 
 
 
1097 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43665  predicted protein  22.27 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  25.27 
 
 
1209 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.43 
 
 
828 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>