More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82025 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_82025  predicted protein  100 
 
 
460 aa  966    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.830676 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  56.3 
 
 
447 aa  513  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_50969  predicted protein  43.64 
 
 
456 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627207  hitchhiker  0.000441065 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44047  predicted protein  40.22 
 
 
463 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.298129  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05930  snoRNA binding protein, putative  38.29 
 
 
1382 aa  345  8e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.02 
 
 
1196 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.8 
 
 
1652 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.48 
 
 
1262 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 
1557 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.25 
 
 
1686 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.06 
 
 
1163 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.22 
 
 
682 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.96 
 
 
1188 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.25 
 
 
1240 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
464 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.09 
 
 
1474 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.31 
 
 
1363 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.81 
 
 
1364 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.35 
 
 
664 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 
947 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.56 
 
 
1221 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 
728 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  21.88 
 
 
578 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 
1443 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.92 
 
 
630 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.05 
 
 
919 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.29 
 
 
1607 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 
1789 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 
1193 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.24 
 
 
1357 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.76 
 
 
1247 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.36 
 
 
676 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
1267 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.15 
 
 
576 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.19 
 
 
344 aa  86.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.78 
 
 
1161 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 
1348 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.56 
 
 
675 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.21 
 
 
1242 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  26.54 
 
 
657 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 
737 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.64 
 
 
1868 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.65 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.58 
 
 
1552 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 
696 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 
1236 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.36 
 
 
740 aa  84  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  24.22 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.13 
 
 
1161 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.37 
 
 
596 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.54 
 
 
1213 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.65 
 
 
1211 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.73 
 
 
1901 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.24 
 
 
1217 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1711 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  24.76 
 
 
774 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.18 
 
 
677 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.7 
 
 
1190 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.98 
 
 
1208 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.04 
 
 
1229 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.95 
 
 
930 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 
1510 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.6 
 
 
1523 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  23.17 
 
 
1344 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 
1807 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 
1858 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.84 
 
 
1760 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.67 
 
 
1609 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.17 
 
 
1481 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.76 
 
 
1553 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.2 
 
 
1454 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.11 
 
 
1547 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  27.62 
 
 
652 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  27.38 
 
 
335 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.4 
 
 
733 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.87 
 
 
698 aa  76.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.03 
 
 
1164 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.61 
 
 
742 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  22.67 
 
 
778 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.37 
 
 
692 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.61 
 
 
924 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  21.98 
 
 
1477 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.05 
 
 
642 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  22.77 
 
 
687 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  24.77 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.46 
 
 
716 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.52 
 
 
1411 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.59 
 
 
1599 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.83 
 
 
1190 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.29 
 
 
1177 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.43 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25.35 
 
 
1416 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.46 
 
 
1214 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  22.47 
 
 
344 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  22.26 
 
 
1100 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.45 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  24.05 
 
 
452 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>