More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29180 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_29180  predicted protein  100 
 
 
505 aa  1053    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.648326  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05196  mRNA splicing factor (Prp17), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07300)  41.56 
 
 
531 aa  326  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202062  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02290  pre-mRNA splicing factor, putative  39.57 
 
 
615 aa  316  5e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54743  predicted protein  39.71 
 
 
347 aa  284  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0297675  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  41.4 
 
 
500 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.8 
 
 
1217 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.25 
 
 
1236 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.57 
 
 
1364 aa  95.1  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.96 
 
 
1557 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.06 
 
 
1652 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.62 
 
 
443 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.26 
 
 
1454 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 
1363 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.7 
 
 
596 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 
947 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.13 
 
 
1789 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.48 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.99 
 
 
1221 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.06 
 
 
676 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.66 
 
 
1211 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 
1163 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 
1474 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.67 
 
 
919 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 
1177 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.01 
 
 
1176 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.76 
 
 
677 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.68 
 
 
1607 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.44 
 
 
1213 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.16 
 
 
1205 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.34 
 
 
1711 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.48 
 
 
1304 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.58 
 
 
1262 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.15 
 
 
1348 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.01 
 
 
1477 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 
1599 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.02 
 
 
1242 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 
1240 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.3 
 
 
1760 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.9 
 
 
1523 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.47 
 
 
1367 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.13 
 
 
1510 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.67 
 
 
1196 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.25 
 
 
1599 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  26.59 
 
 
657 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.39 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.05 
 
 
1357 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 
1686 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.48 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  24.17 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.47 
 
 
1481 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.76 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  24.76 
 
 
1416 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.73 
 
 
740 aa  73.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  25.35 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26 
 
 
1484 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.3 
 
 
1553 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.23 
 
 
642 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.22 
 
 
1193 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_12918  predicted protein  23.84 
 
 
304 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.393166 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.81 
 
 
1411 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.33 
 
 
1188 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  29.41 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  27.61 
 
 
774 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.63 
 
 
698 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.88 
 
 
1901 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 
1190 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.59 
 
 
692 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.63 
 
 
1188 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.05 
 
 
1247 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  21.65 
 
 
1190 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.52 
 
 
675 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.62 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.49 
 
 
1858 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  24.49 
 
 
1427 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25 
 
 
565 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  23.02 
 
 
1878 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  21 
 
 
522 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  28.5 
 
 
473 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  26.21 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.14 
 
 
1609 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  26.14 
 
 
840 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.1 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.09 
 
 
1229 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.68 
 
 
924 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.52 
 
 
778 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  23.43 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.66 
 
 
1209 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.75 
 
 
1661 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.83 
 
 
1831 aa  67  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.04 
 
 
578 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  23.64 
 
 
782 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  24.84 
 
 
935 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  26.63 
 
 
367 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.5 
 
 
1164 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.96 
 
 
742 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30495  predicted protein  24.56 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  22.92 
 
 
516 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.91 
 
 
1443 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  22.73 
 
 
1016 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>