64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68798 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_68798  periodic tryptophan protein 1  100 
 
 		 566 aa  1162    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.715644 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  44.4 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01250  conserved hypothetical protein  32.59 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118456  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  35.6 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  32.84 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.92 
 
 		 1760 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.64 
 
 		 1193 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.46 
 
 		 696 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05930  snoRNA binding protein, putative  21.19 
 
 		 1382 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1196 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 1443 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.63 
 
 		 664 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 		 1474 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.31 
 
 		 1686 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  23.79 
 
 		 447 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.67 
 
 		 1188 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1427 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43574  predicted protein  26.23 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.88 
 
 		 1652 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  29.27 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80311  component of the COPII coat of ER-Golgi vesicles  23.36 
 
 		 1244 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.53 
 
 		 1609 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.97 
 
 		 676 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.21 
 
 		 1163 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 		 1236 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  30.85 
 
 		 523 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.03 
 
 		 757 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.65 
 
 		 682 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 		 772 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 		 772 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  26.14 
 
 		 534 aa  47  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 712 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  23.48 
 
 		 778 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 1711 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1355 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  28.03 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.85 
 
 		 636 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1858 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  23.56 
 
 		 1289 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06257  Protein transport protein sec31 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZM3]  23.98 
 
 		 1282 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0130265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.63 
 
 		 1411 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.59 
 
 		 1208 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 		 1878 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21897  G protein beta subunit  27.1 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.45 
 
 		 865 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88512  PPI family transporter: peroxisomal targeting signal type 2 receptor (PEX7)  23.21 
 
 		 344 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44047  predicted protein  19.77 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.298129  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01940  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 		 1507 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60422  Anaphase promoting complex, Cdc20, Cdh1, and Ama1 subunits  25.32 
 
 		 606 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0258517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 		 1363 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  25.88 
 
 		 518 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  22.86 
 
 		 1357 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 762 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 		 1213 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  25 
 
 		 359 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  22.49 
 
 		 1217 aa  43.9  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  26.45 
 
 		 363 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  26 
 
 		 511 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.06 
 
 		 833 aa  43.9  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  23.11 
 
 		 466 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.73 
 
 		 943 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25.86 
 
 		 564 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>