More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3307 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  100 
 
 		 347 aa  670    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  73.93 
 
 		 349 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  73.93 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  71.06 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  70.2 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  59.65 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  58.91 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  52.89 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50.43 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  52.79 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  52.85 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  51.43 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3991  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4428  inner-membrane translocator  51.97 
 
 		 359 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 373 aa  225  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0935  inner-membrane translocator  55.22 
 
 		 352 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 364 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 363 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.73 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 360 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  34.75 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  36.83 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.14 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.14 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  33.84 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  32.95 
 
 		 360 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  32.38 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  33.05 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  33.43 
 
 		 363 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 367 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 362 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  37 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 359 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 365 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.18 
 
 		 368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  30.88 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 383 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>