More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2786 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  100 
 
 		 349 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  58.45 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  58.91 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  59.31 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  59.89 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  58.79 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  58.91 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  57.93 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  63.53 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  57.31 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  57.31 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  61.01 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  58.17 
 
 		 349 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  65.81 
 
 		 354 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3991  inner-membrane translocator  69.01 
 
 		 363 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4428  inner-membrane translocator  64.71 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  40.11 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0935  inner-membrane translocator  60.17 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.54 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.75 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  38.22 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 354 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  39.03 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 361 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 367 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.04 
 
 		 367 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  35.44 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  38.37 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  33.14 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  34.09 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  38.54 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  33.24 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  32.96 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 371 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 350 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.65 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  33.81 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  38.29 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 360 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.55 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>