More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1780 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  100 
 
 		 357 aa  702    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  61.93 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  53.01 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  42.49 
 
 		 365 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  42.15 
 
 		 344 aa  257  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  42.15 
 
 		 344 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 338 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  37.78 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 370 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  37.82 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 462 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  39.78 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  39.78 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.15 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.67 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.71 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  40 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  38.73 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.75 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 365 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.96 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.26 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.46 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 363 aa  167  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 410 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  28.61 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 408 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.24 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 364 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  31.42 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  33.72 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 377 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>