More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1299 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  83.02 
 
 		 376 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  100 
 
 		 377 aa  761    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  83.88 
 
 		 376 aa  621  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  60.56 
 
 		 365 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  52.08 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  55.92 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  50.67 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  51.07 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  51.98 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  53.93 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  51.77 
 
 		 364 aa  352  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  52.17 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  52.6 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  52.33 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  51.51 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  52.05 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  51.09 
 
 		 367 aa  289  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 362 aa  215  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  43.13 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 344 aa  187  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  38.25 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 340 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.31 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 360 aa  163  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  39.34 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.97 
 
 		 471 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 665 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.05 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 351 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.66 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 347 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.13 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 388 aa  142  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.94 
 
 		 419 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.93 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  28.45 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.75 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1651  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 624 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.758453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 365 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  28.61 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>