More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2844 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  100 
 
 		 372 aa  738    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  75.89 
 
 		 364 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  77.6 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  76.5 
 
 		 364 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  76.5 
 
 		 364 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  69.42 
 
 		 362 aa  491  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  74.31 
 
 		 392 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  58.56 
 
 		 376 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  52.94 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  53.74 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  51.07 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  56.7 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  55.89 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  59.61 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  55.92 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  46.81 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  51.55 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  36.47 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.47 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.59 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 371 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 442 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.45 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 371 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.65 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 345 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.33 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  34.5 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  32.66 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 665 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 528 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 454 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 383 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.74 
 
 		 349 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.94 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  32.69 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 351 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 357 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  28.13 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.62 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  28.42 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.21 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 462 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  29.29 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.29 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>