More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0809 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  91.84 
 
 		 441 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  100 
 
 		 437 aa  851    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  52.57 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  48.76 
 
 		 451 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  47.59 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  48.1 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  53.49 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  51.59 
 
 		 427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  49.59 
 
 		 454 aa  306  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  48.56 
 
 		 415 aa  302  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  53.14 
 
 		 408 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  50.93 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  50.73 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  50.12 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  44.63 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 371 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  36.13 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 		 365 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 356 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  36.47 
 
 		 354 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  36.47 
 
 		 354 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  44.94 
 
 		 379 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  39 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 348 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  35.7 
 
 		 367 aa  180  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  40.06 
 
 		 352 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  40.06 
 
 		 352 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 352 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 372 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 		 365 aa  173  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 365 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.74 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 376 aa  170  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 409 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 370 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 463 aa  166  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 352 aa  163  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  39.18 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 364 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 357 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  46.64 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.96 
 
 		 355 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 377 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.16 
 
 		 381 aa  152  8.999999999999999e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  36.25 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 373 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 347 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.51 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 347 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  39.85 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 340 aa  137  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.6 
 
 		 353 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 361 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.16 
 
 		 364 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>