More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2320 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  94.57 
 
 		 350 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  97.83 
 
 		 368 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  100 
 
 		 368 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  60.73 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  54.24 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  54.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  51.91 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  55.25 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  52.89 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  53.17 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  53.01 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  54.52 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  53.17 
 
 		 369 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  50.99 
 
 		 383 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  53.91 
 
 		 387 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  51.98 
 
 		 359 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  51.27 
 
 		 368 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  52.53 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  47.79 
 
 		 368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  47.03 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  51.26 
 
 		 361 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  55.06 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  47.04 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  48.59 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  48.87 
 
 		 364 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  48.19 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  50 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  50.56 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  48.32 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  49.29 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  46.89 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  46.61 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  49.86 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  44.69 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  46.72 
 
 		 362 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  49.29 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  45.05 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  45.79 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  46.72 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  46.72 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  45.13 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  44.93 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  45.53 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  49.09 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  49.09 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  48.63 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  47.63 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  42.38 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 358 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 354 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.37 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 365 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.96 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  31.65 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.96 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.05 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 383 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  28.92 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>