More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4172 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  100 
 
 		 367 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  89.62 
 
 		 367 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  80.6 
 
 		 376 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  67.87 
 
 		 377 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  64.03 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  59.72 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  52.08 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  56.7 
 
 		 372 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  53.06 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  53.11 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 362 aa  363  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  54.55 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  52.62 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  55 
 
 		 392 aa  316  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.62 
 
 		 364 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  52.89 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  53.93 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  42.64 
 
 		 367 aa  239  8e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 442 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.08 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  34.96 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  35.63 
 
 		 379 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.15 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  33.77 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.04 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.04 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 528 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.76 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.62 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.99 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.81 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 441 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 354 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.23 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1651  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 624 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.758453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  33.24 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  33.24 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  30.4 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.58 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>