More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0678 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  100 
 
 		 380 aa  731    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  65.17 
 
 		 383 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  53.57 
 
 		 528 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  56.14 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  50 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 375 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  52.2 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  33.04 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  30.87 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 364 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  33.33 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 358 aa  126  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  28.85 
 
 		 365 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  34.24 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  34.24 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  28.65 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.62 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.63 
 
 		 419 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 392 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.4 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.21 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  37 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 417 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  26.47 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>