More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3947 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  100 
 
 		 408 aa  768    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  55.58 
 
 		 451 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  56.2 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  55.49 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  54.91 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  52.17 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  55.86 
 
 		 454 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  52 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  54.81 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  53.56 
 
 		 471 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  54.13 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  50.39 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  48.89 
 
 		 414 aa  305  7e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  51.23 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  58.52 
 
 		 413 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  48.97 
 
 		 544 aa  259  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  45.43 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  50.45 
 
 		 371 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  46.43 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  40.18 
 
 		 391 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  42.64 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 348 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 357 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 352 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  45.78 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  40 
 
 		 357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  40.8 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 		 352 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 		 352 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.17 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.26 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 365 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  40 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 		 352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 		 352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  40.68 
 
 		 352 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  40.68 
 
 		 352 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 		 352 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 377 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  38.18 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 355 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.91 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  36.75 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 369 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  35.67 
 
 		 369 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  42.11 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 463 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.47 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>