More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1302 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  100 
 
 		 347 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  61.6 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  61.03 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  59.65 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  59.31 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  58.91 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  59.03 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  51.3 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  51.72 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  52.37 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  51 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  53.28 
 
 		 354 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3991  inner-membrane translocator  53.8 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4428  inner-membrane translocator  50.98 
 
 		 359 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0935  inner-membrane translocator  56.48 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 355 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 361 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.84 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.81 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  33.43 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  31.73 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.92 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  32.1 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.96 
 
 		 369 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  32.48 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.86 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  34.58 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 350 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 361 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.09 
 
 		 368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.74 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  33.89 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 358 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  36.92 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>