More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1580 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  100 
 
 		 372 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  38.78 
 
 		 365 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  36.97 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  36.97 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.48 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 357 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.18 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 454 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.71 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  36.08 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.96 
 
 		 471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.9 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.29 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  30 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 463 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.75 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 408 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.41 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.29 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 414 aa  142  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  28.74 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  29.94 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  29.06 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>