More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1987 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  99.42 
 
 		 347 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  100 
 
 		 347 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  97.69 
 
 		 347 aa  587  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  78.45 
 
 		 349 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  60.83 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  54.62 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  53.09 
 
 		 347 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  53.77 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  53.46 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 347 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  50.43 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  52.83 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  54.29 
 
 		 360 aa  278  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  54.39 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3991  inner-membrane translocator  56.82 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4428  inner-membrane translocator  55.86 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.58 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 364 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0935  inner-membrane translocator  56 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  34.49 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  38.92 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 363 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  36.53 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 361 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 369 aa  175  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  32.19 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  34.46 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  33.71 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  33.52 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 369 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 364 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  31.91 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  35.63 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.31 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  32.95 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.96 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.08 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  32.29 
 
 		 362 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  32 
 
 		 362 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  34.75 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 442 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>