More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4428 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4428  inner-membrane translocator  100 
 
 		 359 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  76.6 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  71.87 
 
 		 360 aa  411  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  68.04 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  54.49 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3991  inner-membrane translocator  68.98 
 
 		 363 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  52.78 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  55.69 
 
 		 347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  51.97 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  55.99 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  52.79 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  52.51 
 
 		 349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  57.59 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55.69 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  54.37 
 
 		 347 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  53.5 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0935  inner-membrane translocator  61.61 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 354 aa  179  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  35.59 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.02 
 
 		 365 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  36.42 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.78 
 
 		 391 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.99 
 
 		 356 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.11 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  35.96 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  32.65 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 369 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  33.76 
 
 		 362 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  35.96 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  33.42 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  34.67 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  33.15 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 344 aa  143  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 344 aa  143  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  33.83 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>