More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1065 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  97.51 
 
 		 362 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  100 
 
 		 362 aa  698    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  99.17 
 
 		 362 aa  696    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  86.46 
 
 		 362 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  63.35 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  58.1 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  60.22 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  59.72 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  58.4 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  54.37 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  57.95 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  58.03 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  57.5 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  55.84 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  56.41 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  57.38 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  58.81 
 
 		 357 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  51.14 
 
 		 369 aa  329  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  56.94 
 
 		 354 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  48.89 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  44.73 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  49.72 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  47.37 
 
 		 367 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  49.72 
 
 		 358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  45.81 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  50.28 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  48.46 
 
 		 361 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  46.72 
 
 		 368 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  49 
 
 		 355 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  46.99 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  48.15 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  45.25 
 
 		 361 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  44.44 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  44.17 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  45.51 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  45.68 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  45.53 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  44.01 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  46.82 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  43.73 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  45.3 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  45.03 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  46.22 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  34.18 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.9 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.18 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.82 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  33.23 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>