More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4849 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  100 
 
 		 383 aa  752    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  75.07 
 
 		 369 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  65.08 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  56.47 
 
 		 380 aa  358  7e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 363 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.68 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 358 aa  160  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  35.37 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.96 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.91 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 367 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  33.72 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.79 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.86 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  33.87 
 
 		 362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  31.96 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 442 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  31.31 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.95 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  36 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  33.72 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 359 aa  136  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  31 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  31.8 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  32.79 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 365 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 362 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  36.81 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>