More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1699 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  693    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  99.17 
 
 		 363 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  95.29 
 
 		 364 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  79.11 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  58.19 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  57.79 
 
 		 363 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  59.26 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  51.69 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  50.85 
 
 		 361 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  50.56 
 
 		 361 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  49.72 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 364 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  49.72 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 367 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  53.59 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  46.83 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  46.83 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  46.17 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  49 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  49.72 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  48.7 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  49 
 
 		 383 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 355 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  48.88 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  47.74 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  49.72 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  47.74 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  48.58 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  49.25 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  49.29 
 
 		 357 aa  268  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  48.3 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  46.15 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  47.86 
 
 		 370 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  44.73 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  44.82 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  46.26 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 369 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  45.25 
 
 		 360 aa  255  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  43.82 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  47.76 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  42.78 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  43.79 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  43.58 
 
 		 361 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 362 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  42.15 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 354 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.13 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.47 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  37.76 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.27 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  40.16 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  27.35 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.02 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.68 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>