More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3174 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  100 
 
 
362 aa  701    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  85.64 
 
 
362 aa  577  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  87.29 
 
 
362 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  86.46 
 
 
362 aa  567  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  63.59 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  61.14 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  61.97 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  60.17 
 
 
369 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  59.61 
 
 
369 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  56.9 
 
 
364 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  60.8 
 
 
368 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  58.77 
 
 
369 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  59.66 
 
 
383 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  61.97 
 
 
357 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  60.85 
 
 
359 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  56.82 
 
 
369 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  59.66 
 
 
360 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  61.43 
 
 
370 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  60.8 
 
 
357 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  51.71 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  57.51 
 
 
354 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  51.42 
 
 
364 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  45.71 
 
 
355 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  51.99 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  48.32 
 
 
368 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  50.71 
 
 
360 aa  318  9e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  48.32 
 
 
368 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  49.86 
 
 
367 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  47.88 
 
 
361 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  50.43 
 
 
355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  50.42 
 
 
358 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  49.72 
 
 
361 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  48.29 
 
 
350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  51.27 
 
 
367 aa  301  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  47.31 
 
 
361 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  44.19 
 
 
368 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  44.48 
 
 
366 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  47.06 
 
 
363 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  46.29 
 
 
363 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  44.19 
 
 
366 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  46 
 
 
363 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  46.52 
 
 
361 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
360 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  45.86 
 
 
365 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  47.38 
 
 
366 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  43.98 
 
 
360 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  43.7 
 
 
360 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  45.58 
 
 
365 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  46.8 
 
 
366 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  44.2 
 
 
366 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  43.42 
 
 
360 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  47.62 
 
 
356 aa  252  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  44.04 
 
 
361 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  44.51 
 
 
363 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  44.95 
 
 
364 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  44.21 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  44.66 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  38.97 
 
 
373 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  38.28 
 
 
357 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
355 aa  205  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
364 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  37.2 
 
 
354 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.9 
 
 
365 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 
360 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.43 
 
 
359 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  39.34 
 
 
365 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  37 
 
 
358 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  34.73 
 
 
349 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.66 
 
 
347 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.48 
 
 
347 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.92 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.24 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.62 
 
 
349 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
347 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  29.78 
 
 
366 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
357 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.55 
 
 
349 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  37.89 
 
 
451 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  36.88 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.7 
 
 
371 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  28.31 
 
 
352 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
350 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  31.83 
 
 
349 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  32.11 
 
 
349 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  33.71 
 
 
354 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  32.95 
 
 
349 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.52 
 
 
360 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  29.46 
 
 
344 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.3 
 
 
471 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  29.76 
 
 
344 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  29.76 
 
 
344 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  27.71 
 
 
357 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  32.13 
 
 
397 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  32.63 
 
 
369 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0986028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>