More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0018 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  100 
 
 		 344 aa  663    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  81.05 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  70.06 
 
 		 344 aa  477  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  70.06 
 
 		 344 aa  477  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  62.83 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  45.35 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  43.3 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 371 aa  265  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  45.95 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 442 aa  235  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 367 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  38.42 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 348 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  40.17 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  41.52 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  39.43 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  40 
 
 		 388 aa  208  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 364 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  42.22 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  42.21 
 
 		 471 aa  205  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  39.94 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  39.94 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 426 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  43.11 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  36.42 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.33 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 403 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.51 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.7 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 343 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 365 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 454 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 376 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  34.88 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 462 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.6 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 366 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.85 
 
 		 366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.42 
 
 		 373 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.54 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 413 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2517  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 386 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.33 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.01 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.71 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>