More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2175 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  100 
 
 		 364 aa  718    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  64.53 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.81 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  38.9 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.57 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  38.08 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.12 
 
 		 367 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 361 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  39.04 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  41.92 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  39.04 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 354 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 391 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  39.23 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  39.06 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.24 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.6 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 349 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  37.26 
 
 		 365 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  37.17 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.01 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  35.26 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  35.15 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  34.07 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 442 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.54 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 383 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  38.36 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 375 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.58 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.4 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 360 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  35.74 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 350 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>