More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3241 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  96.11 
 
 		 360 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  99.44 
 
 		 360 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  100 
 
 		 360 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  77.56 
 
 		 361 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  74.86 
 
 		 360 aa  521  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  72.02 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  67.14 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  52.92 
 
 		 364 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  48.44 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  46.46 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  46.74 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  48.03 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  46.74 
 
 		 367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  47.78 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  47.89 
 
 		 360 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  45.89 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  45.13 
 
 		 368 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  47.03 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  45.04 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  46.74 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  45.04 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  44.38 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  46.5 
 
 		 369 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  46.5 
 
 		 369 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  45.01 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  46.2 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  47.75 
 
 		 357 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  46.35 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  44.35 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  42.34 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  45.61 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  44.08 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  44.85 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  43.98 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 363 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  46.32 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  46.01 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  46.18 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  45.66 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  40.68 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 355 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.42 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.56 
 
 		 349 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 355 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.76 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 347 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.99 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  38.21 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.76 
 
 		 347 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  28.37 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>