More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1692 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  100 
 
 		 367 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  78.71 
 
 		 361 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  80.11 
 
 		 360 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  79.83 
 
 		 358 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  73.58 
 
 		 364 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  70.17 
 
 		 361 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  68.49 
 
 		 367 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  69.03 
 
 		 361 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  56.86 
 
 		 364 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  54.78 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  53.24 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  55.21 
 
 		 363 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  47.85 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  48.23 
 
 		 368 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  50.43 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  48.29 
 
 		 351 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  49.58 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  49 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  48.02 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  51.27 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 363 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  50.99 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  48.89 
 
 		 363 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  51.72 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  49.57 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  48.75 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  50 
 
 		 357 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  49.03 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  48.33 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  49.15 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  46.74 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  50.28 
 
 		 362 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 350 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  48.07 
 
 		 364 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  47.46 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  49.29 
 
 		 365 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  45.79 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  46.18 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  49.15 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  48.01 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  47.88 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 366 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  49.28 
 
 		 357 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  49.57 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 355 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.59 
 
 		 349 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 347 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.29 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  32.94 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.01 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  29.5 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>