More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2767 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  100 
 
 		 365 aa  719    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  46.04 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 352 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 364 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 357 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  38.53 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 355 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  38.72 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  34.8 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 371 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 351 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.86 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 354 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  37.38 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.4 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.91 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  34.23 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 451 aa  195  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  33.24 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  34.68 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 355 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.84 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 360 aa  192  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  35.82 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  35.55 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 		 360 aa  185  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.1 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  34.99 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  34.37 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  34.93 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.73 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.21 
 
 		 471 aa  172  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>