More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1484 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  100 
 
 		 370 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  83.05 
 
 		 383 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  81.95 
 
 		 351 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  85.23 
 
 		 359 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  81.71 
 
 		 368 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  79.56 
 
 		 360 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  82.95 
 
 		 357 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  81.9 
 
 		 357 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  73.73 
 
 		 361 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  65.54 
 
 		 387 aa  434  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  61.13 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  59.89 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  59.26 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  59.38 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  57.18 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  56.82 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  58.52 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  57.66 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  54.27 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  56.27 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  55.99 
 
 		 362 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 368 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  51.13 
 
 		 368 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  57.26 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  51.47 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  48.07 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  48.46 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  48.74 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  49.58 
 
 		 363 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  44.51 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  47.43 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  50.28 
 
 		 363 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  47.43 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  46.61 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  45.85 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  46.09 
 
 		 367 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  48.89 
 
 		 361 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  48.46 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  49.58 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  48.46 
 
 		 358 aa  298  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 367 aa  298  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 360 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  49.41 
 
 		 366 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  45.22 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  50.42 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  44.01 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  47.31 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  45.38 
 
 		 361 aa  282  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  46.52 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  44.19 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  49.07 
 
 		 363 aa  272  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  49.07 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  48.61 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  47.22 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.14 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.07 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.57 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 365 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 347 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.28 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.85 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.61 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3100  inner-membrane translocator  77.42 
 
 		 114 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  27 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  34.69 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 371 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 352 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 451 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 397 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  32.01 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.9 
 
 		 471 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>