More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2146 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  100 
 
 		 362 aa  680    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  79.94 
 
 		 363 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  79.11 
 
 		 363 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  78.45 
 
 		 364 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  58.56 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  59.72 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  61.3 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  51.79 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  51.52 
 
 		 358 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  51.24 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  51.82 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  49.45 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  49.86 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 364 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 367 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  53.74 
 
 		 364 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  47.61 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  48.17 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  48.45 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 369 aa  295  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  50.28 
 
 		 359 aa  288  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  47.63 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  49.86 
 
 		 357 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  47.63 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 350 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  48.58 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  47.74 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 368 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  47.61 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  46.69 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  45.74 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  47.22 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  50 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 		 360 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  41.62 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  45.66 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  46.97 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  46.07 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  47.67 
 
 		 369 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  47.32 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  44.82 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  44.66 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  47.32 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  44.82 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  44.2 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.83 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  44.89 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  43.68 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 354 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 355 aa  182  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  37.01 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.55 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 347 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.84 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  36.64 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4146  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.52 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.45 
 
 		 471 aa  139  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>