More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3631 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  94.44 
 
 		 360 aa  657    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  93.89 
 
 		 358 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  100 
 
 		 361 aa  712    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  79.32 
 
 		 367 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  68.61 
 
 		 361 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  71.99 
 
 		 364 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  72.44 
 
 		 367 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  68.33 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  55.52 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  54.52 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  56.62 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  55.77 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  51.12 
 
 		 364 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  51.28 
 
 		 369 aa  318  7e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  48.31 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  48.9 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  48.43 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  48.15 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  51.24 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  47.88 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  48.58 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  48.16 
 
 		 387 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  49.72 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  49.43 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  48.16 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 360 aa  305  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  50.57 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  49.43 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  49.27 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  47.18 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  49.3 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  47.43 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  46.5 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  48.35 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  48.89 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  48 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  46.78 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  48.17 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  48.46 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  48.18 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  48.03 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  47.63 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  49 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  46.72 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 373 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 354 aa  195  9e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.4 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 358 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.76 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  35.96 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.86 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.59 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  31.04 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>