More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0839 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  100 
 
 		 369 aa  732    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  60.73 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  60.17 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  60.06 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  56.9 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  55.75 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  61.49 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  56.82 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  54.89 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  54.78 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  56.46 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  56.9 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  54.27 
 
 		 370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  54.73 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  54.44 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  55.87 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  53.45 
 
 		 368 aa  359  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  53.3 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 368 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  50.14 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  54.44 
 
 		 369 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  49.86 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  55.46 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 361 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  49.16 
 
 		 367 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  52.84 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  51.69 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  48.55 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  51.28 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  51.71 
 
 		 362 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  51.3 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  51.3 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  51.14 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  53.63 
 
 		 366 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  50.87 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  51.14 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  51.73 
 
 		 363 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  51.14 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  50.43 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  51.81 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  48.55 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  47.78 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  47.65 
 
 		 360 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  48.04 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  45.76 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  45.4 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  48.05 
 
 		 363 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  47.45 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  47.4 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  44.07 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  48.86 
 
 		 362 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 373 aa  268  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  47.88 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  42.32 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.88 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 352 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.26 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 360 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.05 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 349 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.05 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  31.64 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.64 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  31.64 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 360 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.3 
 
 		 471 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>