More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1356 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  100 
 
 		 354 aa  688    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  61.49 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  60.86 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  58.33 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  56.29 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  58.33 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  55.17 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  56.61 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  55.4 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  53.12 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  57.26 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  55.68 
 
 		 368 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  55.06 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  55.06 
 
 		 368 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  55.24 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  52.41 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  53.54 
 
 		 369 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  54.96 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  55.91 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  58.62 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  57.51 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  52 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  47.46 
 
 		 355 aa  349  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  51.71 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  55.24 
 
 		 369 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  55.65 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  50.28 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  56.37 
 
 		 362 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  54.6 
 
 		 350 aa  341  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 364 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  56.94 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  56.66 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  50.72 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  51 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  51.29 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  50.57 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  52.72 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  54.26 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  50.42 
 
 		 360 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  52 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  51.25 
 
 		 360 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  51.72 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  49.86 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  50.43 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  52.12 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  51.26 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  54.29 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  49.16 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  53.93 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  50.6 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  45.01 
 
 		 373 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  48.42 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  49.85 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  49.69 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  49.69 
 
 		 363 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  50 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 358 aa  229  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 355 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  41.02 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.86 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.63 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.2 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.92 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.85 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 352 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  32.65 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 382 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4146  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.8 
 
 		 427 aa  155  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>