More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4143 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  100 
 
 		 382 aa  748    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 366 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.95 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  32.74 
 
 		 361 aa  166  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  32.36 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  33.71 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.43 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.82 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  30.99 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 349 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 364 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  33 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  28.65 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 355 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 364 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  30.7 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  26.89 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  27.38 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  25.96 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  30.84 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  24.42 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  26.71 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  26.97 
 
 		 365 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  27.35 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.74 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 367 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 349 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  27.38 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  26.01 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  29.41 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  30.5 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  26.7 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 366 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  25.69 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.17 
 
 		 347 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 359 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.34 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.63 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.14 
 
 		 373 aa  110  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>