More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1608 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  100 
 
 
381 aa  749    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  57.1 
 
 
373 aa  396  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  45.83 
 
 
355 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  45.48 
 
 
364 aa  299  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  52.3 
 
 
353 aa  296  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  42 
 
 
356 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  41.74 
 
 
348 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  39.48 
 
 
352 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
352 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
352 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
352 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
352 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  39.19 
 
 
352 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  39.19 
 
 
352 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
352 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
365 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.82 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
365 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
391 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
352 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 
365 aa  176  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  28.89 
 
 
403 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
343 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.75 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  35.17 
 
 
357 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
357 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30.29 
 
 
372 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
371 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
340 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
344 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.41 
 
 
388 aa  159  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.15 
 
 
371 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  34.57 
 
 
442 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  30.95 
 
 
400 aa  153  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  31.83 
 
 
353 aa  153  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.7 
 
 
367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.32 
 
 
373 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
365 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
344 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
350 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  32.26 
 
 
426 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.04 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  35.86 
 
 
344 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.17 
 
 
427 aa  139  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  31.51 
 
 
364 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
360 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  32.75 
 
 
377 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  31.98 
 
 
437 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
355 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  29.84 
 
 
372 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  33.89 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  33.74 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.93 
 
 
338 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  32.05 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.97 
 
 
454 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.18 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3639  branched-chain amino acid transport system, permease, N-terminus  37.4 
 
 
249 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  29.73 
 
 
376 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  27.7 
 
 
359 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  29.39 
 
 
365 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
462 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
408 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  30.75 
 
 
417 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
392 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.45 
 
 
419 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  32.15 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  30.68 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  37.74 
 
 
410 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
414 aa  119  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  32 
 
 
364 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  32.61 
 
 
364 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  33.52 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  30.38 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  25.86 
 
 
366 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  26.15 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  30.79 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  32.09 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  35.41 
 
 
413 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  29.07 
 
 
349 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.36 
 
 
363 aa  114  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 
852 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  28.34 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  29 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
371 aa  113  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.89 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  25.75 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  29.67 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.22 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>