More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0144 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  100 
 
 		 400 aa  801    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.42 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 348 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 344 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.69 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  37.76 
 
 		 352 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  37.76 
 
 		 352 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 352 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.24 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 409 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 451 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.03 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.37 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.87 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  32 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1651  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 624 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.758453 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.11 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 379 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  28.95 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.89 
 
 		 349 aa  146  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 342 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  27.17 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  27.17 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  30.85 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0638  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 613 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 377 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  36 
 
 		 475 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  31.49 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 665 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  28.98 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>