More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3177 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  100 
 
 		 358 aa  681    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  35 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.34 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 356 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  33.15 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  34.86 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  34.86 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.08 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.43 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  27.82 
 
 		 403 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.7 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.84 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 454 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 417 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.97 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.56 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  26.93 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  27.22 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.37 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 369 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 426 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.6 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.14 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  27.25 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 852 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>