More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0526 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  100 
 
 		 392 aa  765    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  74.31 
 
 		 372 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  73.08 
 
 		 364 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  79.73 
 
 		 364 aa  534  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  79.18 
 
 		 364 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  78.9 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  68.6 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  53.85 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  52.6 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  54.7 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  53.83 
 
 		 376 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  55.49 
 
 		 377 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  55 
 
 		 367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  57.02 
 
 		 376 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  55 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  56.99 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 367 aa  263  6e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  52.66 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 365 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 362 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  43.67 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.98 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 344 aa  173  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  38.02 
 
 		 342 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  38.49 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.26 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 348 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 442 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 358 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.91 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.93 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 366 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.37 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.91 
 
 		 471 aa  146  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 360 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.4 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 352 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  29.33 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.74 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.63 
 
 		 427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  32.66 
 
 		 365 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.54 
 
 		 364 aa  136  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  30.99 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  38 
 
 		 408 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 364 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.27 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  28.77 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 665 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>