More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3175 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  100 
 
 
379 aa  739    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  46.21 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  42.52 
 
 
442 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  47.76 
 
 
371 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  43.11 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  41.19 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
365 aa  242  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  46.45 
 
 
451 aa  239  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  42.62 
 
 
356 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  39.77 
 
 
357 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  41.62 
 
 
344 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  41.62 
 
 
344 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  41.39 
 
 
426 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  44.94 
 
 
437 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  45.99 
 
 
408 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  42.25 
 
 
348 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
391 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  45.67 
 
 
454 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  42.6 
 
 
419 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  41.55 
 
 
352 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  41.6 
 
 
462 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  39.44 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  39.44 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  43.98 
 
 
415 aa  223  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  42.07 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  44.18 
 
 
417 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
352 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 
352 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  36.78 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  44.26 
 
 
471 aa  216  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  41.64 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  43.02 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  41.24 
 
 
352 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  41.24 
 
 
352 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 
352 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  38.29 
 
 
362 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  45.54 
 
 
441 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
352 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 
352 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 
352 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  38.7 
 
 
357 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  37.08 
 
 
367 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  40.85 
 
 
427 aa  203  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  42.2 
 
 
365 aa  202  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  45.32 
 
 
410 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  42.94 
 
 
414 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
350 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
373 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
365 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
400 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
365 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  40.33 
 
 
347 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  42.25 
 
 
413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.68 
 
 
372 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.21 
 
 
349 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
365 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  37.23 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
367 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  36.93 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.11 
 
 
373 aa  179  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
403 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.15 
 
 
355 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  35.14 
 
 
372 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  39.81 
 
 
377 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  42.25 
 
 
349 aa  176  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  33.79 
 
 
376 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.59 
 
 
352 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32 
 
 
364 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  34.79 
 
 
377 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  44.86 
 
 
544 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  34.06 
 
 
358 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  35.06 
 
 
367 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.79 
 
 
364 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
383 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  39.37 
 
 
349 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  37.34 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.91 
 
 
355 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
379 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  32.55 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  38.28 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
355 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  30 
 
 
343 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  38.35 
 
 
338 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
347 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  34.11 
 
 
376 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  37.93 
 
 
349 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.06 
 
 
368 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  31.34 
 
 
364 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.01 
 
 
359 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  41.57 
 
 
340 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
364 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
369 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
369 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  32.21 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>