More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0422 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  100 
 
 
391 aa  776    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  45.79 
 
 
365 aa  298  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  45.82 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  45.82 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  45.35 
 
 
344 aa  277  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
371 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  44.57 
 
 
365 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  38.4 
 
 
357 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  44.57 
 
 
365 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  40.97 
 
 
352 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  43.52 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  45.43 
 
 
356 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  39.34 
 
 
362 aa  249  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  40.96 
 
 
371 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  45.85 
 
 
344 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  46.09 
 
 
348 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  39.1 
 
 
377 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  42.01 
 
 
352 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.66 
 
 
442 aa  235  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  42.28 
 
 
352 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  42.28 
 
 
352 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  40.22 
 
 
365 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  41.81 
 
 
376 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  39.23 
 
 
357 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
372 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  37.17 
 
 
376 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  38.21 
 
 
372 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
451 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  39.67 
 
 
352 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  41.71 
 
 
388 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  37.66 
 
 
462 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  42.39 
 
 
352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  42.39 
 
 
352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 
352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  34.27 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.64 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  41.58 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.53 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  36.89 
 
 
354 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  36.89 
 
 
354 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
417 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
364 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  36.99 
 
 
367 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  39.06 
 
 
362 aa  206  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
360 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  35.8 
 
 
426 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  38.3 
 
 
427 aa  203  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  36.55 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  42.94 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  40.77 
 
 
350 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
437 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.98 
 
 
454 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  36.12 
 
 
363 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  35.61 
 
 
376 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  39.7 
 
 
419 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  37.8 
 
 
377 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.71 
 
 
373 aa  190  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
338 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  41.85 
 
 
370 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
379 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.87 
 
 
471 aa  187  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.52 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  41.06 
 
 
414 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.22 
 
 
381 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  36.06 
 
 
340 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.51 
 
 
365 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  40.18 
 
 
408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
364 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
400 aa  179  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
343 aa  179  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  33.91 
 
 
353 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
379 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  36.2 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.96 
 
 
355 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  37.19 
 
 
345 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
342 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
413 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  39.03 
 
 
365 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  37.43 
 
 
364 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  30.35 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
665 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  36.99 
 
 
441 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 
364 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
345 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.48 
 
 
364 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
528 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.62 
 
 
353 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  35.85 
 
 
409 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
358 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>