More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3237 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  100 
 
 		 528 aa  1035    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  59.2 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  56.42 
 
 		 357 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  52.68 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  53.57 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  48.75 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  53.25 
 
 		 375 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 400 aa  216  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 367 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 344 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 376 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 377 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  35.71 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 345 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 376 aa  143  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 371 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.15 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  31.58 
 
 		 365 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.57 
 
 		 427 aa  136  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 362 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 344 aa  136  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  32.91 
 
 		 345 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 383 aa  132  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.4 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 340 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 388 aa  128  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  33.1 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 		 365 aa  126  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 356 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 348 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 352 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  32 
 
 		 365 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 426 aa  120  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 340 aa  117  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 357 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 364 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  33.13 
 
 		 352 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  33.13 
 
 		 352 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 352 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.65 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 364 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.29 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 364 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf822  sugar ABC transporter permease protein  34.65 
 
 		 677 aa  108  3e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 334 aa  108  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  30 
 
 		 365 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 408 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 351 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 351 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  27.14 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.17 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>