210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf822 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf822  sugar ABC transporter permease protein  100 
 
 
677 aa  1365    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
852 aa  164  6e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 
365 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.37 
 
 
365 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
365 aa  131  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.03 
 
 
403 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  30.84 
 
 
371 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  32.37 
 
 
354 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  32.37 
 
 
354 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.19 
 
 
365 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  29.95 
 
 
391 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
442 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0014  ribose/galactose ABC transporter  29.19 
 
 
736 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.77 
 
 
355 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  29.64 
 
 
371 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  35.66 
 
 
528 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  29.69 
 
 
451 aa  110  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  30.93 
 
 
358 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  31.12 
 
 
376 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.74 
 
 
377 aa  108  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  26.51 
 
 
372 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  29.51 
 
 
356 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  29.83 
 
 
376 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
363 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl667  ribose ABC transporter permease component  24.58 
 
 
612 aa  102  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.75 
 
 
388 aa  102  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  27.12 
 
 
360 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  28.18 
 
 
400 aa  100  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
357 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.05 
 
 
362 aa  100  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
383 aa  98.6  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  32.16 
 
 
367 aa  99  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  28.99 
 
 
348 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  31.09 
 
 
475 aa  98.2  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.09 
 
 
471 aa  95.1  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.43 
 
 
463 aa  94  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.9 
 
 
352 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  29.02 
 
 
448 aa  92  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  27.88 
 
 
367 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  30.83 
 
 
414 aa  92  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  29.03 
 
 
344 aa  92.4  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  31.87 
 
 
344 aa  91.7  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
409 aa  90.9  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.42 
 
 
381 aa  89.7  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  28.32 
 
 
462 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  28.32 
 
 
417 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  29.41 
 
 
362 aa  87.8  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  26.6 
 
 
427 aa  87.8  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  28.83 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  28.83 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  27.36 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  27.25 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  28.71 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.86 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  30.12 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  26.36 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  25.66 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  30.18 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  25.78 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  29.54 
 
 
353 aa  82.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  26.55 
 
 
338 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  30.55 
 
 
338 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  30 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  28.34 
 
 
365 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  32.19 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  28.85 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  29.49 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.97 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  28.14 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  27.88 
 
 
380 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  30.72 
 
 
364 aa  80.5  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  27.38 
 
 
376 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.31 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.8 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  27.33 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  27.24 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  29.2 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.12 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  25.76 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 
352 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  26.48 
 
 
352 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  27.05 
 
 
408 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  26.14 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  26.14 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  28.67 
 
 
665 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  28.12 
 
 
340 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  26.99 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  27 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  26.87 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  27.09 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  30.42 
 
 
364 aa  72  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  26.48 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  25.9 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  26.14 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>