242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0014 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0014  ribose/galactose ABC transporter  100 
 
 		 736 aa  1489    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  29.4 
 
 		 852 aa  146  2e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 365 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.03 
 
 		 365 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl667  ribose ABC transporter permease component  25.66 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf822  sugar ABC transporter permease protein  29.28 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 391 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  25.93 
 
 		 371 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 365 aa  105  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 403 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 388 aa  97.8  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.79 
 
 		 355 aa  97.8  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 344 aa  96.3  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 344 aa  96.3  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  24.93 
 
 		 358 aa  92.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 371 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 367 aa  91.7  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 451 aa  88.6  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 347 aa  88.2  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 357 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 356 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  27.38 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  28.15 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 376 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 343 aa  83.2  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  27.68 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  26.72 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  26.9 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.84 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  28.29 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  28.29 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 352 aa  77  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.9 
 
 		 364 aa  76.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 334 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  24.72 
 
 		 359 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  27 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.33 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.4 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  24.32 
 
 		 368 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  26.73 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  23.4 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  25.38 
 
 		 462 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 363 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  23.75 
 
 		 334 aa  72  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  25.19 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 		 352 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  24.84 
 
 		 448 aa  70.5  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  25.85 
 
 		 417 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 380 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 		 353 aa  70.1  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 364 aa  69.7  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  26.45 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  25.99 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  28.57 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  24.43 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  25.61 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  28 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  27 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  21.28 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  26.14 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.71 
 
 		 372 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  24.9 
 
 		 347 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 349 aa  66.6  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  25.87 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  26.54 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  24.3 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  25.52 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  25.9 
 
 		 437 aa  63.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0852  inner-membrane translocator  26.07 
 
 		 362 aa  63.9  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>