200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl667 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl667  ribose ABC transporter permease component  100 
 
 
612 aa  1201    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  28.01 
 
 
852 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 
365 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.84 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0014  ribose/galactose ABC transporter  26.07 
 
 
736 aa  125  2e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.54 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  30.32 
 
 
356 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf822  sugar ABC transporter permease protein  24.58 
 
 
677 aa  107  8e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  27.4 
 
 
403 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  28.27 
 
 
372 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
344 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  30.09 
 
 
344 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  30.1 
 
 
388 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  29.11 
 
 
347 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  32.22 
 
 
344 aa  98.6  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  29.19 
 
 
358 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  28.78 
 
 
348 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
347 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  30.34 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  32.71 
 
 
365 aa  93.6  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
347 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.45 
 
 
365 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.41 
 
 
381 aa  89  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  28.25 
 
 
357 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  29.97 
 
 
373 aa  88.2  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  29.47 
 
 
415 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.16 
 
 
364 aa  87.4  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.06 
 
 
355 aa  87  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  26.17 
 
 
391 aa  86.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  26.21 
 
 
442 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  28.9 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  29.54 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  28.9 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.24 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  29.37 
 
 
462 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  28.2 
 
 
454 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  27.43 
 
 
352 aa  83.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  29.7 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  27.14 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  30.32 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  30.97 
 
 
349 aa  82  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  28.62 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  27.12 
 
 
359 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  28.52 
 
 
427 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  29.94 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  27.49 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  26.62 
 
 
360 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.24 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  26.36 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  29.58 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  27.49 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  30.04 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  28.36 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  28.24 
 
 
376 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  28.09 
 
 
376 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  29.18 
 
 
475 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  26.35 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  29.02 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  28.33 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  28.62 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  29.59 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.41 
 
 
544 aa  71.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  26.86 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  25.48 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  26.38 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  26.03 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  24.32 
 
 
366 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  27.44 
 
 
349 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  24.25 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  28.33 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  24.86 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  25.35 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  25.6 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  26.54 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  24.66 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  25.19 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  28.52 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  27.24 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  26.15 
 
 
369 aa  67  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  27.61 
 
 
349 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  26.09 
 
 
409 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  22.93 
 
 
360 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  27.52 
 
 
413 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
363 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  29.12 
 
 
338 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  26.95 
 
 
387 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.35 
 
 
362 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.74 
 
 
392 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  26.15 
 
 
366 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  23.15 
 
 
360 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 
383 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  26.24 
 
 
361 aa  65.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  25.8 
 
 
369 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  28.83 
 
 
364 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  29.21 
 
 
340 aa  64.3  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.555245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>